Les biologistes ont retrouvé des traces des effets de la sélection naturelle sur le VIH (virus de l’immunodéficience humaine). Ils ont constaté que les virus qui s’accumulent dans le sang en plus grande quantité, et donc plus infectieux, réussissent mieux à se reproduire. Les scientifiques ont suivi cette tendance au cours des 10 dernières années et elle semble indépendante de la stratégie VIH. L’étude est publié dans la revue Nature Communications.
La théorie classique de l’évolution suggère que la sélection naturelle agit sur tous les organismes capables de se multiplier. Par conséquent, nous pouvons supposer qu’il pourrait agir sur les virus, permettant à l’un d’entre eux de se reproduire avec plus de succès que l’autre. Cependant, les traces d’une telle exposition sont assez difficiles à détecter.
Pour de telles études, le VIH est un modèle très pratique, car de nombreuses personnes en sont infectées et elles sont régulièrement testées. Joel Wertheim de l’Université de Californie, avec ses collègues, a recueilli des données sur 41 409 patients qui ont subi des tests sanguins pour le diagnostic.
Ils ont mesuré le nombre de particules virales dans le sang avant le traitement. Il s’agit d’un trait génétiquement déterminé dans le VIH qui affecte l’infectiosité du virus; plus il y a de particules, plus leurs chances de pénétrer dans le corps d’une autre personne sont élevées et peuvent donc être criblées.
Pour évaluer le succès de la propagation des virus, les chercheurs ont comparé la séquence de leur gène de transcriptase inverse et des groupes génétiques isolés – des groupes de patients infectés par des virus identiques ou très similaires. Plus la taille du cluster est grande, plus un virus particulier est efficace.
Les scientifiques ont constaté que chez les patients faisant partie des grappes génétiques, la concentration du virus dans le sang est significativement plus élevée (p <0,001) que chez les patients qui ne font pas partie des grappes. De plus, chez les personnes diagnostiquées à un stade précoce de la maladie, cette dépendance est plus forte que chez celles qui l'ont reçue plus tard.
Ensuite, les auteurs des travaux ont vérifié comment le nombre de particules virales dans le sang lors du diagnostic initial a changé au cours de la dernière décennie. Ils ont constaté que la charge virale à tous les stades augmentait (p <0,001) de 2007 à 2016. Par exemple, aux premiers stades de la maladie en 2007, une moyenne de 13020 particules par millilitre de sang a été trouvée chez les patients, et en 2016 déjà 22100.
En outre, les scientifiques ont remarqué que le nombre de particules virales dans le sang dépend également du degré auquel le patient (ou plutôt le virus avec lequel il est infecté) est inclus dans le cluster génétique. Autrement dit, chaque lien génétique supplémentaire a augmenté la charge virale (p <0,001).
Ainsi, les chercheurs ont retrouvé des traces des effets de la sélection naturelle sur le VIH. Des virus plus infectieux, qui s’accumulent en plus grandes quantités dans le sang, se retrouvent dans de plus grands groupes de patients – c’est-à-dire qu’ils se propagent mieux dans la population. De plus, avec le temps, le VIH évolue vers une plus grande infectivité.
Quelques scientifiques croyez que cela peut être une conséquence logique de la stratégie 90-90-90 (90 pour cent des personnes infectées reçoivent un diagnostic, 90 pour cent d’entre elles reçoivent un traitement, 90 pour cent d’entre elles se débarrassent du virus dans le sang) et qu’elle peut favoriser le développement de souches plus infectieuses. Cependant, à en juger par de nouvelles données, la tendance à l’augmentation de l’infectiosité est stable et ne dépend pas de la stratégie de lutte contre l’infection.
Récemment, des scientifiques ont identifié un nouveau sous-type de VIH – pour la première fois en 20 ans. Le développement d’un implant biodégradable est également apparue récemment, ce qui pourrait éviter aux gens de devoir constamment prendre des médicaments pour combattre le virus. De plus, les scientifiques effacé les souris du VIH en utilisant le système CRISPR / Cas9 et les médicaments antirétroviraux, et le premier patient au monde déjà reçu des cellules sanguines modifiées CRISPR / Cas9.
